Plateaux techniques & équipements
Nos plateaux techniques constituent un levier essentiel dans une démarche d’amélioration de l’organisation des laboratoires et des structures de recherche. En mutualisant les instruments de mesure, les espaces et les compétences, ils permettent d’améliorer la performance organisationnelle tout en répondant aux objectifs de qualité et de pertinence scientifique. Cette organisation favorise une utilisation plus rationnelle des ressources et limite les redondances. La centralisation des moyens techniques contribue également à renforcer la fiabilité de nos résultats et la qualité du travail réalisé.
L’efficacité de nos plateaux techniques repose également sur une structuration autour de référents chargés d’accompagner les utilisateurs, d’assurer le suivi des équipements et de garantir le respect des bonnes pratiques d’utilisation. Ils jouent ainsi un rôle clé dans la diffusion des connaissances, la formation des utilisateurs et le maintien d’un haut niveau d’exigence technique et méthodologique. Au-delà du simple partage de matériel, les plateaux techniques favorisent une dynamique collective d’amélioration continue, de collaboration et de montée en compétences au sein de l’unité.
Plateaux techniques
Localisations :
- Primaire : 4e Centre
- Lignée et Lentivirus : 5e Centre
- Bactériologie : 5e Centre Est
Responsable :
- Bertrand Meresse - Bureau E413b
Référent Primaire :
- Marie Delbeke - Bureau E409
- Solenne Dezitter - Bureau E412
Référent Lignée :
- Manel Jendoubi - Bureau C529
- Solange Vivier - Bureau C518
Référent Lentivirus :
- Noémie Legrand - Bureau E4220
Référent Bactériologie :
- Valérie Gouyer - Bureau C507b
Équipements
Histologie : Cryostat, Microtome, Stations d’inclusion, de fixation, de coloration, de démasquage…
Microscopie : Deux microscopes, lumière visible, fluorescence, scan (DMi8), Stéréomicroscope
Contacts
Responsable : Madjid DJOUINA
Réfèrent histologie : Christophe WAXIN & Léonie VANDOMBER
Réfèrent microscopie : Matthias DANES
Ce plateau contient tous les équipements nécessaires afin de pouvoir mesurer l’expression génique sur tout type de tissus ou cellules : un broyeur, un robot d’extraction, un microspectrophotomètre, un bioanalyseur, 2 thermocycleurs classiques et 2 thermocycleurs temps-réel.
Référente: Mathilde BODY-MALAPEL
Équipements:
- PSM et Incubateur CO2
- Robot de pipettage (Hamilton Microlab Prep)
- Lecteur de plaques multi-mode (BMG ClarioStar PLUS):
- 96 / 384 puits - TR-FRET
- Absorbance - AlphaScreen
- Luminescence - injecteur
- Fluorescence
Applications en Plaques jusqu'à 384 puits:
- Dosage de cytokines, de phospho-protéines et de modifications post-traductionnelles
- Études d'interactions ligand-récepteurou d'interactions protéine-protéine
- Études de l'activités enzymatiques, de seconds messagers …
Référents: Amélie BARCZYK & Xavier DEZITTER
Référent: Manel JENDOUBI
Equipements communs hors plateaux
Localisation: C503
Responsable: Jean-Luc DESSEYN
Référents: Valérie GOUYER & Léonie VANDOMBER
Localisation: E407
Référent: Arnaud DENDOOVEN
Localisation: C530
Référent: Rodolphe CARPENTIER
Localisation: E418
Référent: Ségolène PLET
Utilisateurs habilités:
- Alexis LARGY
- Mathys BUISINE
- Hugo WEBER
- Ségolène PLET
Equipements à disposition au sein de l'unité
L’objectif de notre plateforme technique est de mettre à disposition notre expertise et nos outils moléculaires afin d’analyser la traduction et la stabilité de l’ARNm, ainsi que de générer des constructions lentivirales. Notre équipe propose les services suivants :
- Centrifugation sur gradient de densité. La centrifugation sur gradient de sucrose permet de séparer l’ARN libre de l’ARNm associé aux ribosomes.
- Isolement / fractionnement des polysomes. L’analyse des ARNm liés aux ribosomes constitue une approche puissante pour étudier l’activité traductionnelle. Notre plateforme de fractionnement permet de purifier les ARNm activement traduits à partir d’une large gamme de tissus et de types cellulaires de mammifères, ainsi que d’autres organismes (par exemple : bactéries, levures, parasites). L’ARN polysomal peut ensuite être utilisé pour des applications en aval telles que le séquençage d’ARN ou l’analyse par RT-qPCR.
- Tests de stabilité de l’ARN/immunoprécipitation de ribonucléoprotéines (RIP). Divers facteurs comme les ARN non codants et les protéines liant l’ARN (RBP), régulent le devenir de l’ARNm (traduction et dégradation) et jouent des rôles clés dans les processus physiologiques et pathologiques. Nous apportons un soutien pour la conception et la réalisation de tests de stabilité de l’ARN dans vos modèles in vitro. De plus, nous proposons une expertise en tests RIP afin d’identifier les cibles directes des ARNm des RBP.
- Clonage moléculaire, constructions lentivirales. Vous souhaitez surexprimer ou inhiber un gène d’intérêt in vitro? Ou générer des lignées cellulaires stables? Nous offrons un accompagnement complet pour les stratégies de clonage et la production lentivirale. Nos ressources incluent des plasmides pour l’emballage lentiviral ainsi que des constructions permettant d’exprimer des régulateurs clés de la traduction et de la stabilité de l’ARNm (par exemple : RBP, eIF2α).
- Injection hydrodynamique de plasmides chez la souris. Pour les études ciblant le foie, nous proposons une expertise en injection hydrodynamique par la veine caudale afin de délivrer efficacement des plasmides aux hépatocytes in vivo.
- Analyse, conseil, accompagnement et formation. Nous aidons également à la conception expérimentale, à l’analyse des données, et proposons des formations personnalisées ainsi que du conseil scientifique.
Contacts:
- Dr. Noémie LEGRAND, PhD - Scientific supervision. (noemie.legranduniv-lille.fr)
- Pr. Cyril Sobolewski, Ph.D (cyril.sobolewskiuniv-lille.fr): Academical supervision.
- Mrs. Ophélie Bertin, MSc (ophelie.bertinuniv-lille.fr): Technical support.
Références:
- Legrand et al, PLoS One, 2014.
- Legrand et al, Nucleic Acids Research, 2015.
- Legrand et al, Cancers, 2021.
- Sobolewski et al, CMGH, 2021.
- Sobolewski C, Dubuquoy L and Legrand N, Cancers, 2022.
- Sobolewski et al, Cancers, 2022.