Microenvironnement épithélial : une approche intégrée pour explorer les mécanismes de régénération et de fibrose dans les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin
EPIREPAIR — EPIthelial REPAIR mechanisms in chronic inflammation
Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) sont des pathologies récidivantes du tractus gastro-intestinal, caractérisées par une activation immunitaire pathologique contre une dysbiose du microbiome chez un individu génétiquement prédisposé. Elles se divisent en deux entités, la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique, et se caractérisent par des vagues de rechute et de rémission de l'inflammation qui conduisent à des troubles fonctionnels digestifs associant des symptômes tels que diarrhées glairo-sanglantes, douleurs abdominales et altération de l’état général des patients. On dénombre plus de 300 000 personnes prises en charge pour une MICI en France et on estime que ces pathologies concernent plus de 5 millions d’individus dans le monde. À ce jour, aucun traitement médicamenteux ne permet de guérir des MICI dont la physiopathologie reste imparfaitement comprise. C’est dans ce contexte que s’inscrit le projet développé par notre équipe, qui vise à caractériser de manière approfondie les mécanismes de régénération de l’épithélium intestinal, un processus clé pour restaurer l’intégrité de la barrière muqueuse. Notre objectif est d’identifier les facteurs responsables des dysfonctionnements épithéliaux qui contribuent au déclenchement et à la chronicisation des MICI.
La régénération repose sur l’activité coordonnée des cellules souches intestinales, de leurs voies de signalisation et de leur interaction avec le microenvironnement inflammatoire et microbien. Parallèlement, le stroma, les fibroblastes activés et la dysbiose modifient le contexte métabolique et mécanique dans lequel l’épithélium tente de se régénérer. Ainsi, la compréhension intégrée des interactions entre cellules épithéliales, cellules stromales, immunité et microbiote est désormais considérée comme une clé pour identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques visant à restaurer une réparation efficace et prévenir la fibrose dans les MICI.
Grâce à un accès privilégié aux prélèvements de patients, notre équipe explore ces interactions à l’aide de modèles organotypiques avancés (organoïdes, organoïdes sur puce, coupes intestinales épaisses viables) qui permettent de reproduire in vitro les échanges entre l’épithélium, le stroma et le microbiote. Nous complétons ces approches par des modèles animaux expérimentaux reproduisant fidèlement la physiopathologie des MICI, tels que les modèles DSS ou TNBS. Nos explorations s’appuient à la fois sur des techniques conventionnelles (qRT-PCR, Western blot, histologie, immunohistochimie) et sur des approches multiomiques intégratives (single-cell, transcriptomique, protéomique), afin d’identifier les circuits de communication cellulaires impliqués dans la régénération, l’inflammation et les processus fibrosants.
Membres
benjamin.bertin@univ-lille.fr
ORCID : 0000-0002-9160-3717
silvia.speca2@univ-lille.fr
ORCID : 0000-0001-8494-3329
madjid.tagzirt@univ-lille.fr
ORCID : 0000-0001-7914-0695
annie.standaert@univ-lille.fr
ORCID : 0000-0002-7752-3964
pauline.kerbage@chu-lille.fr
ORCID : 0000-0002-7684-6067
Quelques publications représentatives
Articles originaux:
Maxime Costa, Muriel Pottier, Marie Jacob, Pauline Zarnitzky, Benjamin Segain, Martin Figeac, Shéhérazade Sebda, Frédéric Leprêtre, Bertrand Meresse, Julie Demaret, Benoit Foligné, Annie Standaert, Benjamin Bertin. Relevance of mouse and human IBD patient-derived colon organoids to investigate intestinal macrophage differentiation. J Leukoc Biol. 2025 Apr 23;117(4):qiaf004. doi: 10.1093/jleuko/qiaf004.
Adele Ponzoni, Silvia Speca, Matthew Hartle, Amandine Gerstenberg, Aurore Tomezyk, Victor Senechal, Shane Karnik, Laurent Dubuquoy, David Launay, Rebecca Deprez-Poulain, Mathieu Gaudin, Corinne Ramos, Benoit Deprez. An untargeted metabolomic study using MALDI-mass spectrometry imaging reveals region-specific biomarkers associated with bowel inflammation. Metabolomics. 2024 Dec 14;21(1):5. doi: 10.1007/s11306-024-02200-4.
Caroline Valibouze, Silvia Speca, Caroline Dubuquoy, Florian Mourey, Lena M'Ba, Lucil Schneider, Marie Titecat, Benoît Foligné, Michaël Genin, Christel Neut, Philippe Zerbib, Pierre Desreumaux. Saccharomyces cerevisiae prevents postoperative recurrence of Crohn's disease modeled by ileocecal resection in HLA-B27 transgenic rats. World J Gastroenterol. 2023 Feb 7;29(5):851-866. doi: 10.3748/wjg.v29.i5.851.
Dina Chokr, Marjorie Cornu, Christel Neut, Clovis Bortolus, Rogatien Charlet, Pierre Desreumaux, Silvia Speca, Boualem Sendid. Adherent invasive Escherichia coli (AIEC) strain LF82, but not Candida albicans, plays a profibrogenic role in the intestine. Gut Pathog. 2021 Jan 28;13(1):5. doi: 10.1186/s13099-021-00401-z.
Mathurin Fumery, Silvia Speca, Audrey Langlois, Anne-Marie Davila, Caroline Dubuquoy, Marta Grauso, Anthony Martin Mena, Martin Figeac, Daniel Metzger, Christel Rousseaux, Jean-Frederic Colombel, Laurent Dubuquoy, Pierre Desreumaux, Benjamin Bertin. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARγ) regulates lactase expression and activity in the gut. EMBO Mol Med. 2017 Nov;9(11):1471-1481.doi: 10.15252/emmm.201707795.
Anthony Martin Mena, Audrey Langlois, Silvia Speca, Lucil Schneider, Pierre Desreumaux, Laurent Dubuquoy, Benjamin Bertin. The Expression of the Short Isoform of Thymic Stromal Lymphopoietin in the Colon Is Regulated by the Nuclear Receptor Peroxisome Proliferator Activated Receptor-Gamma and Is Impaired during Ulcerative Colitis. Front Immunol. 2017 Sep 4:8:1052.doi: 10.3389/fimmu.2017.01052.
Silvia Speca, Christel Rousseaux, Caroline Dubuquoy, Florian Rieder, Antonella Vetuschi, Roberta Sferra, Ilaria Giusti, Benjamin Bertin, Laurent Dubuquoy, Eugenio Gaudio, Pierre Desreumaux, Giovanni Latella. Novel PPARγ Modulator GED-0507-34 Levo Ameliorates Inflammation-driven Intestinal Fibrosis. Inflamm Bowel Dis. 2016 Feb;22(2):279-92. doi: 10.1097/MIB.0000000000000618.
Guillaume Bouguen, Audrey Langlois, Madjid Djouina, Julien Branche, Dine Koriche, Edmone Dewaeles, Alice Mongy, Johan Auwerx, Jean-Frederic Colombel, Pierre Desreumaux, Laurent Dubuquoy, Benjamin Bertin. Intestinal steroidogenesis controls PPARγ expression in the colon and is impaired during ulcerative colitis. Gut. 2015 Jun;64(6):901-10. doi: 10.1136/gutjnl-2014-307618.
Revues:
Ian C Lawrance, Gerhard Rogler, Giorgos Bamias, Christine Breynaert, Jon Florholmen, Gianluca Pellino, Shimon Reif, Silvia Speca, Giovanni Latella. Cellular and Molecular Mediators of Intestinal Fibrosis. J Crohns Colitis. 2017 Dec 4;11(12):1491-1503. doi:10.1016/j.crohns.2014.09.008.
Guillaume Bouguen, Laurent Dubuquoy, Pierre Desreumaux, Thomas Brunner, Benjamin Bertin. Intestinal steroidogenesis. Steroids. 2015 Nov;103:64-71. doi:10.1016/j.steroids.2014.12.022.
Benjamin Bertin, Laurent Dubuquoy, Jean-Frédéric Colombel, Pierre Desreumaux. PPAR-gamma in ulcerative colitis: a novel target for intervention. Curr Drug Targets. 2013 Nov;14(12):1501-7. doi: 10.2174/13894501113149990162.
Benjamin Bertin, Pierre Desreumaux, Laurent Dubuquoy. Obesity, visceral fat and Crohn's disease. Curr Opin Clin Nutr Metab Care. 2010 Sep;13(5):574-80. doi:10.1097/MCO.0b013e32833cf0f4.